Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms