Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIPEPQ99797 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPEPQ99797 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPEPQ99797 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms