Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16BQ96JE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms