Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC47Q96A33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
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