Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI3KQ59H18 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.6 ms