Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF9Q13886 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF9Q13886 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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