Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 PHO87YCR037C 2772 nt4.44□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 TUB3YML124C 1338 nt4.44□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 UBP10YNL186W 2379 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 KGD1YIL125W 3045 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SFI1YLL003W 2841 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 RRB1YMR131C 1536 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 KEG1YFR042W 603 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SHE1YBL031W 1017 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 PNT1YOR266W 1272 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 UBS1YBR165W 834 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YRB30YGL164C 1323 nt4.43□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SSB2YNL209W 1842 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 PHO13YDL236W 939 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YAL069WYAL069W 315 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SEC65YML105C 822 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YMR130WYMR130W 909 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 RTC5YOR118W 1704 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 EFM2YBR271W 1260 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 MDR1YGR100W 2853 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 PMS1YNL082W 2622 nt4.42□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 GAT2YMR136W 1683 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 RIT1YMR283C 1542 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 PFK1YGR240C 2964 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 MSC2YDR205W 2175 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 MSA1YOR066W 1890 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 TAF5YBR198C 2397 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 TRM1YDR120C 1713 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 CPS1YJL172W 1731 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 APP1YNL094W 1764 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 PCL2YDL127W 927 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 TYW3YGL050W 822 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 ECM15YBL001C 315 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YBL059WYBL059W 582 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YBR016WYBR016W 387 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SSP2YOR242C 1116 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 MGR2YPL098C 342 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 RCK2YLR248W 1833 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 RRI1YDL216C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SYF1YDR416W 2580 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 HRK1YOR267C 2280 nt4.41□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SAP4YGL229C 2457 nt4.4□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SPB4YFL002C 1821 nt4.4□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 MPS3YJL019W 2049 nt4.4□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 KAP114YGL241W 3015 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 CPR4YCR069W 957 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 AIM6YDL237W 1173 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 BET1YIL004C 429 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ARC15YIL062C 465 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YJR056CYJR056C 711 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MDJ2YNL328C 441 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YNR042WYNR042W 429 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 CBF5YLR175W 1452 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 TEL1YBL088C 8364 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RAD28YDR030C 1521 nt4.4□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 IDS2YJL146W 1410 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 URC2YDR520C 2319 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 OKP1YGR179C 1221 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MMM1YLL006W 1281 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 SAP30YMR263W 606 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 snR37snR37 386 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 THI7YLR237W 1797 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 UGA3YDL170W 1587 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ATM1YMR301C 2073 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MSE1YOL033W 1611 nt4.39□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 AKL1YBR059C 3327 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YCR015CYCR015C 954 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YDL124WYDL124W 939 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 HNT2YDR305C 654 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YEL045CYEL045C 426 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YGR016WYGR016W 573 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 FMP33YJL161W 543 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ELF1YKL160W 438 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 CPR6YLR216C 1116 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YMR010WYMR010W 1218 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MUM2YBR057C 1101 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 TAF12YDR145W 1620 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ADP1YCR011C 3150 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MAG2YLR427W 2013 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 BOP2YLR267W 1713 nt4.38□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 EUG1YDR518W 1554 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 snR78snR78 87 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RRG1YDR065W 1098 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 CTH1YDR151C 978 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YDR391CYDR391C 699 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 SNA2YDR525W-A 240 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 CLC1YGR167W 702 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 MNN11YJL183W 1269 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RUF20RUF20 443 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 BUD17YNR027W 954 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 BAG7YOR134W 1230 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 RAD16YBR114W 2373 nt4.37□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 TRE2YOR256C 2430 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 NAM2YLR382C 2685 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 YCL075WYCL075W 441 nt4.36□□□□□ -1.71
NMD4Q12129 ARF2YDL137W 546 nt4.36□□□□□ -1.71
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