Protein–RNA interactions for Protein: Q12085

TY1A-GR1, Transposon Ty1-GR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-GR1Q12085 HAC1YFL031W 717 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 CNN1YFR046C 1086 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 RPF1YHR088W 888 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 YKL115CYKL115C 393 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 COQ9YLR201C 783 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 RNA1YMR235C 1224 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 RKI1YOR095C 777 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 PRP31YGR091W 1485 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 RTK1YDL025C 1863 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 MSN4YKL062W 1893 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 MDL1YLR188W 2088 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 TRP5YGL026C 2124 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 CNE1YAL058W 1509 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 EXG1YLR300W 1347 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 GPA2YER020W 1350 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 RUD3YOR216C 1455 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 snR84snR84 550 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 PDE1YGL248W 1110 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 YHR180WYHR180W 492 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 CAP1YKL007W 807 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 MRP49YKL167C 414 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 YSF3YNL138W-A 258 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 GIM3YNL153C 390 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 STP22YCL008C 1158 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 TAX4YJL083W 1815 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 EPS1YIL005W 2106 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 CDC37YDR168W 1521 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 THG1YGR024C 714 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 GTF1YGR102C 552 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 YKL023WYKL023W 834 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 JLP1YLL057C 1239 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 CDC123YLR215C 1083 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 ELO3YLR372W 1038 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 COS1YNL336W 1146 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-GR1Q12085 TDA3YHR009C 1572 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 NOP2YNL061W 1857 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 TNA1YGR260W 1605 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 FLC3YGL139W 2409 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 CDC1YDR182W 1476 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 CTS2YDR371W 1536 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 MMT1YMR177W 1533 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YVH1YIR026C 1095 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 PET130YJL023C 1044 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 QCR8YJL166W 285 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 RCL1YOL010W 1104 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YCL020WYCL020W 1317 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 ENT1YDL161W 1365 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 FPK1YNR047W 2682 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 PLB2YMR006C 2121 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 GCD1YOR260W 1737 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YDL012CYDL012C 324 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 ERD1YDR414C 1089 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 GUK1YDR454C 564 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 DIG2YDR480W 972 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 UBC8YEL012W 657 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 RAD51YER095W 1203 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 AGX1YFL030W 1158 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YGR114CYGR114C 390 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YJL028WYJL028W 336 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 VMA5YKL080W 1179 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YKL107WYKL107W 930 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YNR005CYNR005C 405 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 TRS33YOR115C 807 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 RCN2YOR220W 798 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 MFM1YPL060W 1242 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 PRM3YPL192C 402 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 OXR1YPL196W 822 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 SMX3YPR182W 261 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YCL049CYCL049C 939 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 MFB1YDR219C 1398 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YAP1801YHR161C 1914 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 SLT2YHR030C 1455 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YLL067CYLL067C 3618 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 NOC4YPR144C 1659 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 PGK1YCR012W 1251 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YER165C-AYER165C-A 357 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YFL051CYFL051C 483 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 CIC1YHR052W 1131 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 RHO4YKR055W 876 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 GSY2YLR258W 2118 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YMR010WYMR010W 1218 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 TRM10YOL093W 882 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 NIP7YPL211W 546 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 COQ1YBR003W 1422 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 STP4YDL048C 1473 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 SET5YHR207C 1581 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 CTK1YKL139W 1587 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 YDR131CYDR131C 1671 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 HIS7YBR248C 1659 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-GR1Q12085 DSE1YER124C 1722 nt5.37□□□□□ -1.55
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