Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YGR022CYGR022C 330 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 MRP4YHL004W 1185 nt5.74□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPF1YHR088W 888 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YHR095WYHR095W 495 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YKL071WYKL071W 771 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 APN1YKL114C 1104 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 COS9YKL219W 1224 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YAR053WYAR053W 297 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 LST8YNL006W 912 nt5.74□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 YNL324WYNL324W 396 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 CLG1YGL215W 1359 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 NOP2YNL061W 1857 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YJR061WYJR061W 2808 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SER3YER081W 1410 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 ASH1YKL185W 1767 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 PDH1YPR002W 1551 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 GSH2YOL049W 1476 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 RAD57YDR004W 1383 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YCR015CYCR015C 954 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 BUD30YDL151C 582 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 RRP8YDR083W 1179 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 CDC43YGL155W 1131 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 NQM1YGR043C 1002 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 FMP48YGR052W 1110 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 EGD2YHR193C 525 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YJL007CYJL007C 315 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YNL146WYNL146W 303 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 BUD17YNR027W 954 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 IZH2YOL002C 954 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YPL113CYPL113C 1191 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 SUE1YPR151C 621 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 ECM3YOR092W 1842 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 RDS2YPL133C 1341 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 APJ1YNL077W 1587 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 VPS70YJR126C 2436 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 MRF1YGL143C 1242 nt5.72□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF3Q07807 VAM7YGL212W 951 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YGR176WYGR176W 348 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 VPS25YJR102C 609 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YML003WYML003W 873 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YML053CYML053C 639 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YBL044WYBL044W 369 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 PNT1YOR266W 1272 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 UBC4YBR082C 447 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF3Q07807 RSC58YLR033W 1509 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 HPF1YOL155C 2904 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDR203WYDR203W 318 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 MXR1YER042W 555 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGR290WYGR290W 444 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 ARC15YIL062C 465 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 GLG2YJL137C 1143 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YKL223WYKL223W 333 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YBL094CYBL094C 333 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 NUP1YOR098C 3231 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YER137C-AYER137C-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YER159C-AYER159C-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 DEG1YFL001W 1329 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YJR026WYJR026W 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YJR028WYJR028W 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YAR010CYAR010C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YML040WYML040W 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YML045W-AYML045W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YMR051CYMR051C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 FOB1YDR110W 1701 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 ACF2YLR144C 2340 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YTM1YOR272W 1383 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 GEP3YOR205C 1671 nt5.7□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF3Q07807 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDL034WYDL034W 345 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 GIR2YDR152W 798 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 GLO2YDR272W 825 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 COS4YFL062W 1140 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 TIM21YGR033C 720 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.4 ms