Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1Q01196 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1Q01196 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms