Protein–RNA interactions for Protein: P40259

CD79B, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD79BP40259 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD79BP40259 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD79BP40259 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD79BP40259 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD79BP40259 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD79BP40259 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD79BP40259 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD79BP40259 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD79BP40259 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD79BP40259 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD79BP40259 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD79BP40259 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD79BP40259 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms