Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS4Y1P22090 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS4Y1P22090 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms