Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC11O43248 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms