Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMG1C9JSJ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms