Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE3A6NKU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE3A6NKU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDYE3A6NKU9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms