Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHA12Q9UN75 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms