Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEFF2Q9UIK5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEFF2Q9UIK5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms