Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD3Q9NX63 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2514.4 ms