Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MED17Q9NVC6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms