Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASS4Q9NQ75 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms