Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms