Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms