Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3BQ96GX2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms