Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF9Q13886 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms