Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	HPC2	YBR215W	1878 nt		5.85	□□□□□ -1.47
NSE3	Q05541	GCN20	YFR009W	2259 nt		5.85	□□□□□ -1.47
NSE3	Q05541	NGL3	YML118W	1518 nt		5.84	□□□□□ -1.47
NSE3	Q05541	ARN1	YHL040C	1884 nt		5.84	□□□□□ -1.47
NSE3	Q05541	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		5.84	□□□□□ -1.47
NSE3	Q05541	JLP1	YLL057C	1239 nt		5.84	□□□□□ -1.47
NSE3	Q05541	PEP4	YPL154C	1218 nt		5.84	□□□□□ -1.47
NSE3	Q05541	MMT1	YMR177W	1533 nt		5.84	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	GPB1	YOR371C	2694 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	GMC1	YDR506C	1827 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	UBX7	YBR273C	1311 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	VPS21	YOR089C	633 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	TAF3	YPL011C	1062 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	ECM8	YBR076W	1065 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	BZZ1	YHR114W	1902 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	RAD30	YDR419W	1899 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	RSC6	YCR052W	1452 nt		5.83	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	DBP5	YOR046C	1449 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SMF1	YOL122C	1728 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	MHF2	YDL160C-A	243 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	CTH1	YDR151C	978 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	HIM1	YDR317W	1245 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YIL163C	YIL163C	354 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	AAD10	YJR155W	867 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YMR082C	YMR082C	357 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YNL171C	YNL171C	369 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	TRS33	YOR115C	807 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	QCR2	YPR191W	1107 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	MAG2	YLR427W	2013 nt		5.82	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	VHS2	YIL135C	1311 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SPR6	YER115C	576 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	TYW3	YGL050W	822 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	ALB1	YJL122W	528 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	HOT13	YKL084W	351 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SHE1	YBL031W	1017 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SPG4	YMR107W	348 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YOR114W	YOR114W	885 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YPL114W	YPL114W	420 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	GRE1	YPL223C	507 nt		5.81	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	PBI1	YPL272C	1554 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	RTK1	YDL025C	1863 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	BUD16	YEL029C	939 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SUI2	YJR007W	915 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	LIP2	YLR239C	987 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SPO19	YPL130W	672 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YEH2	YLR020C	1617 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	IMD3	YLR432W	1572 nt		5.8	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	STD1	YOR047C	1335 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	POL31	YJR006W	1464 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	APC4	YDR118W	1959 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	PLP1	YDR183W	693 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YGL193C	YGL193C	312 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YGR153W	YGR153W	654 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	YAL069W	YAL069W	315 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	NMA1	YLR328W	1206 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SAP30	YMR263W	606 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	EAF7	YNL136W	1278 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SPS19	YNL202W	879 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	MVD1	YNR043W	1191 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	TIF5	YPR041W	1218 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	MRP2	YPR166C	348 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	IMA3	YIL172C	1770 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	IMA4	YJL221C	1770 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SER3	YER081W	1410 nt		5.79	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	AAD4	YDL243C	990 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	AI3	Q0060	1248 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SPR28	YDR218C	1272 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	BMH1	YER177W	804 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	RPL28	YGL103W	450 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	HPM1	YIL110W	1134 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	ELO3	YLR372W	1038 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SLZ1	YNL196C	897 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	MER1	YNL210W	813 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	MAP2	YBL091C	1266 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	REX4	YOL080C	870 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	RGS2	YOR107W	930 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	ALD3	YMR169C	1521 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	ALD2	YMR170C	1521 nt		5.78	□□□□□ -1.48
NSE3	Q05541	SOF1	YLL011W	1470 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	MAK11	YKL021C	1407 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YPR1	YDR368W	939 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YDR391C	YDR391C	699 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	COX18	YGR062C	951 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YJR071W	YJR071W	369 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	GCD7	YLR291C	1146 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	GAB1	YLR459W	1185 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	RRG9	YNL213C	645 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	CYC2	YOR037W	1101 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	YOR062C	YOR062C	807 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	UMP1	YBR173C	447 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	REI1	YBR267W	1182 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	KAR2	YJL034W	2049 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	ALG11	YNL048W	1647 nt		5.77	□□□□□ -1.49
NSE3	Q05541	POL12	YBL035C	2118 nt		5.77	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms