Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHC1P78364 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHC1P78364 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHC1P78364 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHC1P78364 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHC1P78364 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHC1P78364 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHC1P78364 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHC1P78364 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHC1P78364 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHC1P78364 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHC1P78364 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHC1P78364 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHC1P78364 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHC1P78364 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHC1P78364 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHC1P78364 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms