Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH15P55291 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDH15P55291 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDH15P55291 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH15P55291 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH15P55291 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH15P55291 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH15P55291 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH15P55291 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH15P55291 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH15P55291 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms