Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SPAG9O60271 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SPAG9O60271 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms