Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC3O15379 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC3O15379 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms