Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCOR1Q9UKL0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms