Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS50Q96JG6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms