Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N3U1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N3U1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N3U1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N3U1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8N3U1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8N3U1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8N3U1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8N3U1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms