Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT78Q8N1N4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT78Q8N1N4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms