Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms