Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN1Q14699 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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