Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPARCL1Q14515 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPARCL1Q14515 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPARCL1Q14515 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SPARCL1Q14515 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
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