Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms