Protein–RNA interactions for Protein: P25384

TY2B-C, Transposon Ty2-C Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-CP25384 FDH1YOR388C 1131 nt5.63□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 OCA2YNL056W 594 nt5.62□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 CWC27YPL064C 906 nt5.62□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 FLC3YGL139W 2409 nt5.62□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 IDS2YJL146W 1410 nt5.62□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 FDH2YPL275W 711 nt5.62□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 RNR1YER070W 2667 nt5.61□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 PTM1YKL039W 1572 nt5.61□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 YLR012CYLR012C 300 nt5.61□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 RPA43YOR340C 981 nt5.61□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 FAA1YOR317W 2103 nt5.61□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 ACE2YLR131C 2313 nt5.61□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 MSC7YHR039C 1935 nt5.6□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 GAL4YPL248C 2646 nt5.6□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 IRC25YLR021W 540 nt5.6□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 SNF2YOR290C 5112 nt5.6□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 NUG1YER006W 1563 nt5.6□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 MSD1YPL104W 1977 nt5.6□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 YNL095CYNL095C 1929 nt5.59□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 MKK1YOR231W 1527 nt5.59□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 DSF2YBR007C 2211 nt5.59□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 SIP5YMR140W 1470 nt5.59□□□□□ -1.51
TY2B-CP25384 UPC2YDR213W 2742 nt5.59□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 HRK1YOR267C 2280 nt5.58□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 PEX29YDR479C 1665 nt5.58□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 YDL094CYDL094C 510 nt5.57□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 YEL057CYEL057C 702 nt5.57□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 ACK1YDL203C 1872 nt5.57□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 TMA19YKL056C 504 nt5.57□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 PDR16YNL231C 1056 nt5.57□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 RSC1YGR056W 2787 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 CKS1YBR135W 453 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 SVF1YDR346C 1446 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 PEX19YDL065C 1029 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 GTF1YGR102C 552 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 TEF4YKL081W 1239 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 YPL216WYPL216W 3309 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 YCF1YDR135C 4548 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 JIP4YDR475C 2631 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 PHO86YJL117W 936 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 ADD66YKL206C 804 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 PTA1YAL043C 2358 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 TDA7YNL176C 1911 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 BUD14YAR014C 2130 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 SRP101YDR292C 1866 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 FLO5YHR211W 3228 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 RPN2YIL075C 2838 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 SHQ1YIL104C 1524 nt5.53□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 HIM1YDR317W 1245 nt5.53□□□□□ -1.52
TY2B-CP25384 ARN2YHL047C 1863 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 EIS1YMR031C 2532 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 TRX3YCR083W 384 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 YFR035CYFR035C 345 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 MAP1YLR244C 1164 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 YGL218WYGL218W 651 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 VPS73YGL104C 1461 nt5.51□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 YPP1YGR198W 2454 nt5.51□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 PKH1YDR490C 2301 nt5.51□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 RRP17YDR412W 708 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 PWR1PWR1 941 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 SIT1YEL065W 1887 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 NPY1YGL067W 1155 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 CYK3YDL117W 2658 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 RPB3YIL021W 957 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 RPL15AYLR029C 615 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 TCB3YML072C 4638 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 SEG2YKL105C 3399 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 NSA2YER126C 786 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 MRPL51YPR100W 423 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 OCA5YHL029C 2040 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 YNR063WYNR063W 1824 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 CPR6YLR216C 1116 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 APE1YKL103C 1545 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 MDM1YML104C 3384 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 ALR2YFL050C 2577 nt5.46□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 OAF1YAL051W 3144 nt5.46□□□□□ -1.53
TY2B-CP25384 YTM1YOR272W 1383 nt5.46□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 ERJ5YFR041C 888 nt5.46□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt5.46□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 VAC8YEL013W 1737 nt5.46□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 SLI1YGR212W 1407 nt5.46□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 XKS1YGR194C 1803 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 IRS4YKR019C 1848 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 UBX5YDR330W 1503 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 YCL075WYCL075W 441 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 VBA1YMR088C 1689 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 PFA4YOL003C 1137 nt5.44□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 AKR1YDR264C 2295 nt5.44□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 IML2YJL082W 2196 nt5.44□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 RNH203YLR154C 333 nt5.44□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 DIP2YLR129W 2832 nt5.44□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 CDS1YBR029C 1374 nt5.44□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 ZRC1YMR243C 1329 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 PAN1YIR006C 4443 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 POL3YDL102W 3294 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-CP25384 YHR180WYHR180W 492 nt5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms