Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 36.1
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DKC1O60832 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 36.1
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DKC1O60832 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 36.1
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DKC1O60832 SHANK2-207ENST00000425049 557 ntTSL 418.63■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 36
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DKC1O60832 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 36
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DKC1O60832 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 36
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DKC1O60832 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 36
DKC1O60832 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 36
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DKC1O60832 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 36
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DKC1O60832 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 35.8
DKC1O60832 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 35.8
DKC1O60832 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-9■■■■■ 35.8
DKC1O60832 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 35.8
DKC1O60832 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 35.8
DKC1O60832 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 35.8
DKC1O60832 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-21■■■■■ 35.8
DKC1O60832 ITPR2-201ENST00000242737 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 35.7
DKC1O60832 ITPR2-209ENST00000545235 540 ntTSL 1 (best)9.27□□□□□ -0.933e-10■■■■■ 35.7
DKC1O60832 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 35.6
DKC1O60832 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.289e-8■■■■■ 35.6
DKC1O60832 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.119e-8■■■■■ 35.6
DKC1O60832 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.239e-8■■■■■ 35.6
DKC1O60832 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 35.6
DKC1O60832 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 211.81□□□□□ -0.529e-8■■■■■ 35.6
DKC1O60832 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.569e-8■■■■■ 35.6
DKC1O60832 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.611e-323■■■■■ 35.6
DKC1O60832 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 33.82□□□□□ -1.81e-11■■■■■ 35.6
DKC1O60832 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-323■■■■■ 35.6
DKC1O60832 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-323■■■■■ 35.6
DKC1O60832 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 216.98■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 35.6
DKC1O60832 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 35.6
DKC1O60832 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.61□□□□□ -1.195e-48■■■■■ 35.5
DKC1O60832 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.91□□□□□ -1.35e-48■■■■■ 35.5
DKC1O60832 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.345e-48■■■■■ 35.5
DKC1O60832 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 24.04□□□□□ -1.765e-48■■■■■ 35.5
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