Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH4Q9UIA0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTH4Q9UIA0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms