Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNPPD1Q9BV87 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNPPD1Q9BV87 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNPPD1Q9BV87 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNPPD1Q9BV87 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNPPD1Q9BV87 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNPPD1Q9BV87 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms