Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF6Q96J87 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms