Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU5

GRIN3A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3AQ8TCU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN3AQ8TCU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3AQ8TCU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms