Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP9Q8IXQ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms