Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms