Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED27Q6P2C8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED27Q6P2C8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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