Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDRF1Q3B7T1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms