Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF2Q1L5Z9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms