Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM3AP98173 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM3AP98173 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3AP98173 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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FAM3AP98173 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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