Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms